A coleção vem sendo usada como referência na identificação e caracterização de microrganismos de interesse da Fitopatologia, inclusive de microrganismos quarentenários, dá suporte aos trabalhos que vem sendo desenvolvidos na área de controle biológico de fitopatógenos e de plantas daninhas na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia e na Unesp/Jaboticabal e Ribeirão Preto, fornecendo material genético devidamente caracterizado e valorado. Além disso, existe uma parcela de organismos geneticamente modificados que vêm sendo usados em pesquisa de transgênicos.

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