O herbário SJRP foi formalmente instituído em 1977 e está dividido em cinco coleções distintas: Angiospermas, Pteridófitas, Briófitas, Algas e, recentemente, Fungos. A coleção de Fungos do SJRP representa a biodiversidade da região noroeste do Estado de São Paulo e conta com cerca de 490 espécimes.

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Herbário de São José do Rio Preto, SJRP