O Herbário possui mais de 350.000 exsicatas documentando a flora brasileira, acondicionadas em armários especiais e a temperatura controlada. É o melhor documentário da biodiversidade da flora paulista com representantes de todos os grupos vegetais. O Herbário está entre os três maiores do Brasil, em número de exsicatas catalogadas e encontra-se em processo de informatização através do software Brahms.

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