A coleção ficológica do Herbário SPF teve seu início na década de 1950 com os trabalhos do Prof. Aylthon Brandão Joly que, durante
os 20 anos seguintes, trabalhou intensamente em sua estruturação com o auxílio de seus alunos. O Prof. Joly foi substituído pelo
Prof. Eurico Cabral de Oliveira e seus alunos a partir de 1970. O SPF reúne uma das maiores coleções de algas da América Latina,
possuindo espécimes representantes de cerca de 30 países e de praticamente todas as espécies conhecidas do litoral brasileiro. Nele
enumeram-se cerca de 1550 espécies de algas marinhas, sendo 280 da Divisão Chlorophyta, 300 da Classe Phaeophyceae e 950 da Divisão
Rhodophyta, com um total de 72 tipos. Tendo em vista sua importância o herbário é freqüentemente utilizado por pesquisadores de todo o
mundo. Além disso, os próprios alunos de pós-graduação, graduação, professores e pesquisadores associados mantêm um movimento
permanente na coleção, seja através da inclusão de novos espécimes como de revisões do material depositado que podem levar, por
exemplo, a alterações de nomenclatura de parte da coleção existente.